Okulumuz 1964 yılında ortaokul şeklinde Eski Gümrük binasında hizmete açılmış olup 1973 yılında ortaokul-lise halini almıştır.1974 yılında şimdiki binasında hizmet vermeye başlamıştır. Okulumuz ana binası dışında ek bina ile birlikte iki bölümden oluşmaktadır. Kuruluş itibarı ile dersliklerin büyük bir bölümü ana binada toplanmaktadır. Açıldığı dönemde ilçedeki tek klasik lise olmasından dolayı Yüksekova Lisesi adını almıştır. 2022-2023 Eğitim Öğretim Yılında eski binamızdan, Akalın Köyü Küme Evleri mevkisine taşınmıştır.